Chapter 1 异教徒
光环毁灭的余波中，星盟的领袖们急忙在光环附近的“博爱之城”集合。他们听从了议会祭祀们的意见，决定用惩罚星盟舰长的方式来安抚民众。他们告诫他：“朝圣之旅即将开始，你的罪恶将阻碍你，让你无法与我们同行。”最终，星盟舰长被送上了电刑台。
Chapter 2 军械库
在宇宙的另一端，士官长从光环的爆炸中幸存下来，被地球的“开罗”空间站救回。他的装甲需要进行全面的调试。在任务中，士官长先要按照指令做一些瞄准的测试。然后再给自己的装甲充满能量。
跟随电梯内的约翰逊上士
装甲调试完毕后，士官长跟着约翰逊上士走进升降梯。出了升降梯后，玩家还要乘坐缆车，一路上可以欣赏空间站的壮观景象。同时约翰逊向士官长介绍了一下“开罗”空间站的最新情况。缆车到达目的地后，士兵们在门口迎接士官长的归来。胡德（Hood）统帅亲自向士官长、约翰逊上士以及雅各布·凯思舰长的女儿米兰达·凯思（Miranda Keyes）颁发了奖章。就在这时，星盟舰队通过异次元通道抵达地球，向人类发动了攻击……
Chapter 3 开罗航战
击退入侵的星盟敌人
娱乐室里传来枪炮声，士官长准备再次投入战斗。身边有手枪、轻机枪和攻击步枪三种武器可供选择。（注意！轻机枪和手枪是可以双持的。）装备好后，士官长走进娱乐室。这时候，星盟的战士闯了进来。士官长用强大的火力将他们打退。然后沿着楼梯来到中庭，清理掉一些敌人后，从庭院左边的梯子爬上战机停机坪。在这里，星盟的战士源源不断地涌来。在这里，士官长亲眼看到一个空间站被摧毁。消灭完这里的敌人后，来到下层的停机坪，又一个空间站被炸毁。
寻找星盟的炸弹。
爆炸都是星盟埋下的炸弹引起的。“科塔娜”报告说，“开罗”空间站也有一颗炸弹。为了保护空间站，士官长必须找到并拆除这颗炸弹。沿着停机坪的地下通道前进，在这里玩家会遭遇几个隐形的星盟精英战士。之后，在来到一个庭院，干掉敌人后从庭院左边的楼梯走到庭院的另一边。从这里，士官长可以走到空间站的外部。由于外太空没有空气，所有的战斗都只能靠士官长一个人完成。继续清理敌人，在干掉了3个飞行的星盟精英战士后，从右边进入减压室。这里士官长会碰到星盟的另一种飞行战士——甲壳虫。他们的防御力很弱，而且攻击力也很低，所以不难对付。之后，走上升降机。在这里，也有一些飞行的精英战士和其他小兵。乘坐这里的升降机，士官长再次走到空间站的外部。在这里，清理完敌人后，玩家再次经过减压室来到一个大厅。这里就放着星盟的“炸弹”。在停止炸弹的倒计时装置后，士官长突然想到一个大胆的计划，把这颗炸弹带到星盟的巨型战舰上。他打开空间站的舱门，巨大的吸力把炸弹吸出空间站。在炸弹离开空间站的一刹那，士官长抓住了炸弹一起飞向了正向地球靠近的星盟战舰。耀眼的爆炸充满了整个宇宙，士官长在爆炸的冲击波推动下落在了米兰达·凯思驾驶的“鹌鹑”号战舰上。这艘巨大的战舰返回地球，但是战斗还远没有结束……
Chapter 4 外围地带
坚守阵地直到援军到来